Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms