Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssxb8B1AY40 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssxb8B1AY40 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssxb8B1AY40 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssxb8B1AY40 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssxb8B1AY40 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssxb8B1AY40 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssxb8B1AY40 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssxb8B1AY40 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssxb8B1AY40 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssxb8B1AY40 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssxb8B1AY40 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssxb8B1AY40 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssxb8B1AY40 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssxb8B1AY40 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssxb8B1AY40 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssxb8B1AY40 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssxb8B1AY40 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssxb8B1AY40 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ssxb8B1AY40 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ssxb8B1AY40 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Ssxb8B1AY40 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Ssxb8B1AY40 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Ssxb8B1AY40 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssxb8B1AY40 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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