Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CYI0 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CYI0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CYI0 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CYI0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CYI0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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