Protein–RNA interactions for Protein: Q96HA7

TONSL, Tonsoku-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TONSLQ96HA7 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TONSLQ96HA7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TONSLQ96HA7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TONSLQ96HA7 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TONSLQ96HA7 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TONSLQ96HA7 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TONSLQ96HA7 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TONSLQ96HA7 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TONSLQ96HA7 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TONSLQ96HA7 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TONSLQ96HA7 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TONSLQ96HA7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TONSLQ96HA7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TONSLQ96HA7 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TONSLQ96HA7 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TONSLQ96HA7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TONSLQ96HA7 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TONSLQ96HA7 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TONSLQ96HA7 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TONSLQ96HA7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TONSLQ96HA7 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TONSLQ96HA7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TONSLQ96HA7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TONSLQ96HA7 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TONSLQ96HA7 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TONSLQ96HA7 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TONSLQ96HA7 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TONSLQ96HA7 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TONSLQ96HA7 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TONSLQ96HA7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TONSLQ96HA7 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TONSLQ96HA7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TONSLQ96HA7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TONSLQ96HA7 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
TONSLQ96HA7 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
TONSLQ96HA7 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TONSLQ96HA7 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TONSLQ96HA7 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TONSLQ96HA7 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TONSLQ96HA7 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms