Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Rexo1Q7TT28 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rexo1Q7TT28 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms