Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms