Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GAPVD1Q14C86 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
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