Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms