Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms