Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GLI2P10070 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GLI2P10070 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GLI2P10070 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GLI2P10070 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GLI2P10070 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GLI2P10070 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GLI2P10070 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GLI2P10070 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GLI2P10070 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GLI2P10070 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GLI2P10070 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GLI2P10070 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GLI2P10070 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GLI2P10070 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GLI2P10070 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GLI2P10070 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GLI2P10070 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GLI2P10070 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GLI2P10070 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GLI2P10070 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GLI2P10070 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GLI2P10070 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GLI2P10070 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GLI2P10070 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GLI2P10070 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GLI2P10070 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GLI2P10070 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GLI2P10070 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GLI2P10070 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GLI2P10070 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GLI2P10070 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GLI2P10070 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GLI2P10070 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GLI2P10070 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GLI2P10070 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GLI2P10070 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GLI2P10070 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GLI2P10070 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GLI2P10070 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GLI2P10070 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GLI2P10070 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GLI2P10070 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GLI2P10070 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GLI2P10070 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GLI2P10070 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GLI2P10070 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GLI2P10070 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GLI2P10070 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GLI2P10070 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GLI2P10070 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GLI2P10070 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GLI2P10070 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GLI2P10070 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GLI2P10070 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GLI2P10070 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GLI2P10070 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GLI2P10070 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GLI2P10070 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GLI2P10070 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GLI2P10070 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GLI2P10070 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GLI2P10070 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GLI2P10070 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GLI2P10070 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GLI2P10070 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GLI2P10070 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GLI2P10070 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GLI2P10070 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GLI2P10070 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GLI2P10070 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GLI2P10070 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GLI2P10070 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GLI2P10070 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GLI2P10070 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GLI2P10070 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GLI2P10070 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GLI2P10070 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GLI2P10070 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GLI2P10070 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GLI2P10070 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GLI2P10070 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GLI2P10070 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GLI2P10070 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GLI2P10070 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GLI2P10070 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GLI2P10070 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GLI2P10070 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GLI2P10070 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GLI2P10070 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GLI2P10070 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GLI2P10070 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GLI2P10070 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GLI2P10070 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GLI2P10070 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
GLI2P10070 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
GLI2P10070 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
GLI2P10070 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GLI2P10070 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GLI2P10070 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms