Protein–RNA interactions for Protein: O60481

ZIC3, Zinc finger protein ZIC 3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC3O60481 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms