Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APAF1O14727 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APAF1O14727 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APAF1O14727 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
APAF1O14727 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APAF1O14727 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APAF1O14727 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APAF1O14727 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APAF1O14727 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APAF1O14727 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APAF1O14727 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
APAF1O14727 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APAF1O14727 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APAF1O14727 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APAF1O14727 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
APAF1O14727 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APAF1O14727 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APAF1O14727 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APAF1O14727 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APAF1O14727 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APAF1O14727 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APAF1O14727 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APAF1O14727 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APAF1O14727 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APAF1O14727 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APAF1O14727 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APAF1O14727 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APAF1O14727 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APAF1O14727 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APAF1O14727 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
APAF1O14727 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
APAF1O14727 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APAF1O14727 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
APAF1O14727 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APAF1O14727 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APAF1O14727 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APAF1O14727 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APAF1O14727 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APAF1O14727 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APAF1O14727 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APAF1O14727 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APAF1O14727 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APAF1O14727 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APAF1O14727 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APAF1O14727 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APAF1O14727 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APAF1O14727 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APAF1O14727 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APAF1O14727 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APAF1O14727 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APAF1O14727 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APAF1O14727 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APAF1O14727 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APAF1O14727 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APAF1O14727 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APAF1O14727 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APAF1O14727 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APAF1O14727 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APAF1O14727 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APAF1O14727 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APAF1O14727 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APAF1O14727 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APAF1O14727 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
APAF1O14727 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APAF1O14727 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
APAF1O14727 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APAF1O14727 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APAF1O14727 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APAF1O14727 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APAF1O14727 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APAF1O14727 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APAF1O14727 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APAF1O14727 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APAF1O14727 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APAF1O14727 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APAF1O14727 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APAF1O14727 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APAF1O14727 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APAF1O14727 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APAF1O14727 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APAF1O14727 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APAF1O14727 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APAF1O14727 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
APAF1O14727 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APAF1O14727 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APAF1O14727 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APAF1O14727 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APAF1O14727 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APAF1O14727 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
APAF1O14727 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
APAF1O14727 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APAF1O14727 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APAF1O14727 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APAF1O14727 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
APAF1O14727 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APAF1O14727 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APAF1O14727 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APAF1O14727 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APAF1O14727 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APAF1O14727 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms