Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRAPPC8Q9Y2L5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms