Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RBBP8Q99708 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RBBP8Q99708 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms