Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atl3Q91YH5 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atl3Q91YH5 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms