Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms