Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ssxb10Q6XAR7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ssxb10Q6XAR7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ssxb10Q6XAR7 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ssxb10Q6XAR7 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssxb10Q6XAR7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb10Q6XAR7 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb10Q6XAR7 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb10Q6XAR7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb10Q6XAR7 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb10Q6XAR7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb10Q6XAR7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb10Q6XAR7 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb10Q6XAR7 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb10Q6XAR7 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb10Q6XAR7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb10Q6XAR7 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb10Q6XAR7 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb10Q6XAR7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb10Q6XAR7 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb10Q6XAR7 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb10Q6XAR7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb10Q6XAR7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb10Q6XAR7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb10Q6XAR7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb10Q6XAR7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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