Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.67
Odf1Q61999 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms