Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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LAPTM4AQ15012 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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