Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

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Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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SPIDRQ14159 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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SPIDRQ14159 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
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SPIDRQ14159 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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