Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
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GRIN2AQ12879 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
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GRIN2AQ12879 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
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GRIN2AQ12879 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
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GRIN2AQ12879 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
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GRIN2AQ12879 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
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GRIN2AQ12879 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
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GRIN2AQ12879 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
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GRIN2AQ12879 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
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