Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1BQ00975 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms