Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAPZBP47756 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAPZBP47756 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms