Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms