Protein–RNA interactions for Protein: P27352

GIF, Gastric intrinsic factor, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIFP27352 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIFP27352 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIFP27352 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIFP27352 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GIFP27352 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIFP27352 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIFP27352 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIFP27352 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIFP27352 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GIFP27352 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIFP27352 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIFP27352 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIFP27352 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIFP27352 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIFP27352 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIFP27352 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIFP27352 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIFP27352 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIFP27352 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIFP27352 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIFP27352 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIFP27352 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIFP27352 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIFP27352 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIFP27352 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIFP27352 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIFP27352 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIFP27352 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIFP27352 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIFP27352 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GIFP27352 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIFP27352 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIFP27352 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GIFP27352 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIFP27352 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIFP27352 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIFP27352 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIFP27352 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIFP27352 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIFP27352 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIFP27352 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIFP27352 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIFP27352 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIFP27352 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GIFP27352 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIFP27352 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIFP27352 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIFP27352 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIFP27352 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIFP27352 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIFP27352 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GIFP27352 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIFP27352 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIFP27352 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIFP27352 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIFP27352 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GIFP27352 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GIFP27352 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIFP27352 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIFP27352 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIFP27352 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIFP27352 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIFP27352 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIFP27352 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIFP27352 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIFP27352 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIFP27352 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIFP27352 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIFP27352 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIFP27352 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIFP27352 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GIFP27352 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIFP27352 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIFP27352 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIFP27352 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIFP27352 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIFP27352 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIFP27352 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIFP27352 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIFP27352 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIFP27352 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIFP27352 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIFP27352 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIFP27352 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIFP27352 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIFP27352 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIFP27352 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIFP27352 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIFP27352 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIFP27352 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIFP27352 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIFP27352 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIFP27352 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIFP27352 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIFP27352 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIFP27352 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIFP27352 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIFP27352 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIFP27352 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIFP27352 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms