Protein–RNA interactions for Protein: O75387

SLC43A1, Large neutral amino acids transporter small subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC43A1O75387 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC43A1O75387 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC43A1O75387 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC43A1O75387 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC43A1O75387 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC43A1O75387 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC43A1O75387 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC43A1O75387 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC43A1O75387 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC43A1O75387 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC43A1O75387 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC43A1O75387 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC43A1O75387 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC43A1O75387 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC43A1O75387 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC43A1O75387 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC43A1O75387 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC43A1O75387 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC43A1O75387 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC43A1O75387 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC43A1O75387 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC43A1O75387 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC43A1O75387 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC43A1O75387 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC43A1O75387 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC43A1O75387 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC43A1O75387 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC43A1O75387 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC43A1O75387 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC43A1O75387 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC43A1O75387 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC43A1O75387 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC43A1O75387 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC43A1O75387 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC43A1O75387 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms