Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms