Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms