Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPJQ9HC77 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms