Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV22

NSMCE1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE1Q8WV22 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NSMCE1Q8WV22 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms