Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTX3LQ8TDB6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms