Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SAPCD1Q5SSQ6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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