Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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FOXF1Q12946 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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FOXF1Q12946 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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FOXF1Q12946 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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FOXF1Q12946 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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FOXF1Q12946 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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FOXF1Q12946 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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