Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms