Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFITM3Q01628 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IFITM3Q01628 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IFITM3Q01628 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IFITM3Q01628 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFITM3Q01628 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFITM3Q01628 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFITM3Q01628 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
IFITM3Q01628 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
IFITM3Q01628 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IFITM3Q01628 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFITM3Q01628 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
IFITM3Q01628 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFITM3Q01628 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms