Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms