Protein–RNA interactions for Protein: O43556

SGCE, Epsilon-sarcoglycan, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCEO43556 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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SGCEO43556 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCEO43556 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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SGCEO43556 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCEO43556 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCEO43556 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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SGCEO43556 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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SGCEO43556 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCEO43556 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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SGCEO43556 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCEO43556 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCEO43556 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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SGCEO43556 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCEO43556 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCEO43556 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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SGCEO43556 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCEO43556 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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SGCEO43556 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCEO43556 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCEO43556 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCEO43556 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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SGCEO43556 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCEO43556 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCEO43556 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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SGCEO43556 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCEO43556 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCEO43556 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCEO43556 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCEO43556 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCEO43556 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCEO43556 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCEO43556 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCEO43556 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCEO43556 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCEO43556 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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