Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Zfp988F6VKC7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Zfp988F6VKC7 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Zfp988F6VKC7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Zfp988F6VKC7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Zfp988F6VKC7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Zfp988F6VKC7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Zfp988F6VKC7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Zfp988F6VKC7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Zfp988F6VKC7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Zfp988F6VKC7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Zfp988F6VKC7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Zfp988F6VKC7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Zfp988F6VKC7 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Zfp988F6VKC7 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Zfp988F6VKC7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Zfp988F6VKC7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp988F6VKC7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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