Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD71

PPP1R1B, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1BQ9UD71 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP1R1BQ9UD71 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms