Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms