Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms