Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms