Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Sh3rf1Q69ZI1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Sh3rf1Q69ZI1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Sh3rf1Q69ZI1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Sh3rf1Q69ZI1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Sh3rf1Q69ZI1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Sh3rf1Q69ZI1 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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