Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAQ29983 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAQ29983 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAQ29983 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAQ29983 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAQ29983 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAQ29983 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAQ29983 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAQ29983 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAQ29983 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAQ29983 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAQ29983 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAQ29983 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAQ29983 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MICAQ29983 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MICAQ29983 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MICAQ29983 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MICAQ29983 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MICAQ29983 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MICAQ29983 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MICAQ29983 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MICAQ29983 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MICAQ29983 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MICAQ29983 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MICAQ29983 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MICAQ29983 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MICAQ29983 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MICAQ29983 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MICAQ29983 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MICAQ29983 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MICAQ29983 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MICAQ29983 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MICAQ29983 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MICAQ29983 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MICAQ29983 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MICAQ29983 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MICAQ29983 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MICAQ29983 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MICAQ29983 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MICAQ29983 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MICAQ29983 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MICAQ29983 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MICAQ29983 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MICAQ29983 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MICAQ29983 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MICAQ29983 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MICAQ29983 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MICAQ29983 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms