Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
LAMA3Q16787 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAMA3Q16787 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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