Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FAM53BQ14153 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms