Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA1P17302 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA1P17302 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA1P17302 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA1P17302 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA1P17302 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA1P17302 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA1P17302 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA1P17302 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA1P17302 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA1P17302 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA1P17302 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA1P17302 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA1P17302 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA1P17302 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA1P17302 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA1P17302 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA1P17302 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA1P17302 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA1P17302 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA1P17302 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA1P17302 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA1P17302 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA1P17302 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA1P17302 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA1P17302 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA1P17302 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA1P17302 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA1P17302 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA1P17302 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA1P17302 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA1P17302 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA1P17302 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA1P17302 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA1P17302 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA1P17302 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA1P17302 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA1P17302 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA1P17302 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA1P17302 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA1P17302 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA1P17302 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA1P17302 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA1P17302 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA1P17302 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA1P17302 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA1P17302 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA1P17302 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA1P17302 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA1P17302 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA1P17302 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA1P17302 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA1P17302 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA1P17302 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA1P17302 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA1P17302 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA1P17302 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA1P17302 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA1P17302 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA1P17302 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA1P17302 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA1P17302 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA1P17302 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA1P17302 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA1P17302 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA1P17302 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA1P17302 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA1P17302 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA1P17302 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA1P17302 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA1P17302 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA1P17302 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA1P17302 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA1P17302 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA1P17302 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA1P17302 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA1P17302 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA1P17302 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA1P17302 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA1P17302 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA1P17302 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA1P17302 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA1P17302 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA1P17302 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA1P17302 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA1P17302 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA1P17302 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA1P17302 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA1P17302 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA1P17302 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA1P17302 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA1P17302 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA1P17302 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA1P17302 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA1P17302 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA1P17302 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA1P17302 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA1P17302 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA1P17302 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA1P17302 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms