Protein–RNA interactions for Protein: P11308

ERG, Transcriptional regulator ERG, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGP11308 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERGP11308 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERGP11308 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERGP11308 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERGP11308 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERGP11308 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERGP11308 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERGP11308 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERGP11308 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERGP11308 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERGP11308 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERGP11308 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERGP11308 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERGP11308 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERGP11308 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERGP11308 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ERGP11308 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERGP11308 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ERGP11308 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERGP11308 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERGP11308 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERGP11308 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ERGP11308 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERGP11308 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERGP11308 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERGP11308 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ERGP11308 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERGP11308 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERGP11308 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERGP11308 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERGP11308 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERGP11308 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERGP11308 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERGP11308 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ERGP11308 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERGP11308 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERGP11308 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERGP11308 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERGP11308 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERGP11308 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERGP11308 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERGP11308 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERGP11308 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERGP11308 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERGP11308 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERGP11308 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERGP11308 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERGP11308 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERGP11308 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERGP11308 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ERGP11308 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERGP11308 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERGP11308 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERGP11308 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERGP11308 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERGP11308 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERGP11308 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERGP11308 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERGP11308 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ERGP11308 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERGP11308 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ERGP11308 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ERGP11308 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ERGP11308 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ERGP11308 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERGP11308 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERGP11308 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERGP11308 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERGP11308 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERGP11308 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERGP11308 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERGP11308 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERGP11308 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERGP11308 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERGP11308 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERGP11308 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERGP11308 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERGP11308 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERGP11308 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERGP11308 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERGP11308 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERGP11308 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ERGP11308 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERGP11308 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERGP11308 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERGP11308 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ERGP11308 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ERGP11308 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERGP11308 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERGP11308 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERGP11308 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERGP11308 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERGP11308 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERGP11308 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERGP11308 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERGP11308 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERGP11308 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERGP11308 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERGP11308 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERGP11308 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms