Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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ZNF208O43345 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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ZNF208O43345 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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ZNF208O43345 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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ZNF208O43345 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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ZNF208O43345 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF208O43345 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms