Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA11Q9UKX5 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms